关于下呼吸道致病菌的检测

    呼吸道感染是由致病微生物入侵呼吸道并进行繁殖所致的疾病，可分为上呼吸道与下呼吸道感染，其中上呼吸道感染主要为喉部以上部位的感染，例如急慢性鼻炎、喉炎与咽炎；下呼吸道感染为喉部以下部位的感染，包括急慢性气管炎、急慢性肺炎、支气管炎。研究发现，上呼吸道感染以病毒为常见病因，少数由细菌所致；下呼吸道感染则由细菌、病毒、衣原体、支原体、军团菌等微生物所致。

    中国疾病预防控制中心在顶级期刊Nature communications发布了一项来自106个城市、277家哨点医院和92个参考实验室，历时11年的呼吸道传染病监测数据显示，在引起急性呼吸道感染的8种病毒中，排前五的依次为流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、副流感病毒和腺病毒。（见表3）

    在引起急性呼吸道感染的9种细菌中，排前五的依次为肺炎链球菌、肺炎支原体、流血嗜血杆菌、肺炎克雷伯杆菌和铜绿假单胞菌。（见表8）。

    病毒难培养，细菌好培养：其实PCR技术一出现，就在病毒类病原体检测方面表现出了非常突出的优势，因为病毒的培养技术要求比较高，分离困难，荧光PCR技术很快就成为了病毒检测的“金标准”。而细菌的培养条件则没那么严苛，往往通过培养就可以进行鉴定。
    病毒核酸好提取，细菌核酸不好提取：核酸检测的关键是核酸的提取纯化，能不能得到纯度较高的核酸，是后续PCR检测的关键所在。但是不同的病原体核酸得率差异也是比较大的，尤其是以革兰氏阳性菌为主，其细菌破壁，核酸释放往往比较困难。

    病毒大多在PCR实验室做，细菌更多在细菌室做：目前国内有1.2万家的PCR实验室，但是大部分主要开战病毒类核酸检测产品，而细菌类项目往往是细菌室的项目，因此细菌类微生物的核酸检测项目，目前并不广泛，当然这也是未来发展的重要方向。

    去年分子领域特别热门的是以甲乙流、腺病毒、合胞病毒、副流感病毒等这些靶标为主的呼吸道多联检产品，但在实际推广的过程中还是遇到了收费、重复项目、入院后没有标本量等诸多问题。一方面是由于当前的分子诊断市场还在被新冠病毒牵引着，所以并没有回归到正常的路径上，所以除了新冠以外的其他呼吸道病原体还需要一定的时间和空间。

    对于下呼吸道病原体而言，其未来将要取代或者朝向的市场是以细菌培养为主的市场，当然就会直面mNGS,因为目前mNGS主要的优势也是在于病原菌的分析方面。但这个赛道上本身的玩家是比较少的，但细分市场的要求也比较特殊，细菌类的项目开在PCR实验室往往标本量很难起来，如果去微生物实验室替代传统的培养，又会面临着没有PCR实验室的困境，未来应该会朝着分子POCT的方向前景，尤其是一些血流感染菌甚至可以做到床旁。

    总体而言，下呼吸道病原菌这个市场相比病毒市场竞争没那么激烈，充满想象，但仍旧需要长时间的培育，以及更多适宜诊断技术和方法的出现。总体上讲，未来还是不错的。