随着新冠病毒在全球蔓延,对病毒的检测工作变得更加紧迫。但美国在这方面的表现,似乎有点让人捉急!
在新型冠状病毒的检测上,美国并未使用世界卫生组织分发的试剂盒,而是单独研制出一种同类产品。2月初,美国疾病控制与预防中心(CDC,下称:美疾控中心)自研的第一批试剂盒生产出来,随即疾控中心向全美各地的实验室发送了检测工具,还向全球数十个国家的实验室发送。但是!美疾控中心(CDC)2月12日表示,检测试剂盒已经证明存在缺陷,随后被紧急撤回。这批测试套件中的一个部件缺陷,导致全美众多公共卫生实验室无法使用,这样的结果导致,美国CDC可能需要重新制造一种试剂盒试剂。疾控中心此前表示,试剂盒可以在四个小时内得出结果,将帮助全球实验室快速确认新型冠状病毒病例。现在,一个多月过去了,只有加利福尼亚州、伊利诺伊州、内布拉斯加州、内华达州和田纳西州五个州的卫生部门以及美国疾病控制与预防中心,有能力检测这种新冠病毒。据美国有线电视新闻网(CNN)刚刚援引美国疾病控制与预防中心(CDC)以及州和地方政府的统计,截至目前美国共有105例新型冠状病毒感染肺炎病例,死亡人数6人。 报道表示,上述105例新冠肺炎病例包括在公共卫生实验室检测呈阳性并等待疾控中心确认的病例,以及从疾控中心收到阳性结果的确诊病例。据美国政治新闻网站“Politico”3月1日曝料,对于上述事件,美疾控中心的上级部门——美国卫生与公众服务部(HHS)已经展开调查。有公共卫生专家表示,检测能力受到耽搁,使得美国在应对这种病毒时变得迟钝。只是在本周,美国的检测步伐才开始加快。报道指出,美疾控中心在亚特兰大的实验室显然出现了一个试剂盒制造上的缺陷,这种情况已经引起了联邦各卫生机构和官员之间的相互指责,他们都在一场重大的公共卫生危机中受到严密的审查。 美疾控中心用于新冠病毒的核酸检测试剂盒 图自美疾控中心网站目前还不清楚哪些高级卫生官员、哪些机构知道美疾控中心存在的检测问题,以及他们何时获悉这些问题。1日晚间,卫生与公众服务部的一位发言人说,该部门正在召集美疾控中心以外的一个科学家小组,来调查检测手段的进展及缺陷。卫生与公众服务部没有透露更多有关专家身份的细节,也没有表明这些专家是否包括政府和外部科学家。美国“Axios”新闻网首先报道了卫生与公众服务部的调查,并表示试剂盒某个部件受到污染可能是问题所在。卫生与公众服务部的一名官员称,相关问题现在已经得到解决。“Politico”报道称,目前尚不清楚为什么美疾控中心开发了自己的检测手段,而不是依赖于世界卫生组织分发的试剂盒。一些专家认为,该机构是想要一种能“更好地排除其他病毒”的检测方法。另据《华尔街日报》报道,美国食品药品监督管理局(FDA)局长斯蒂芬•哈恩(Stephen Hahn)1日晚间在一份声明中说,该局已被提醒注意美疾控中心可能存在的相关问题,其官员已经与美疾控中心进行合作,以确定某些试剂盒组件的缺陷是由于制造问题造成的。
那么,这个核酸试剂到底是什么怎么难研发呢?病毒检测又是怎么做的呢?
实际上,新冠病毒SARS-CoV-2的检测采用的是一种应用非常广泛的核酸检测手段、被称为金标准的即时聚合酶链式反应(qPCR)。
RT PCR技术经常被用来检测HIV病毒、乙肝病毒等病原体。RT PCR 的主要工作原理就是通过只对特定病毒有效的试剂制造大量的病毒核酸镜像,从而检测这种病毒是否出现在样本,比如病人的鼻涕里。
我们先来看看RT PCR的具体过程吧。
首先,先用高温把病毒的双链DNA拆成2根单链,拆开的目的就是为了制造它的镜像。当然,有些病毒(如HIV病毒和新型冠状病毒)的遗传物质不是DNA,而是RNA,也就是说它只有一条链。那么在做的时候稍微麻烦一点,要先把它变成双链的,然后再拆开来。
引物和单链DNA结合
接着就要开始制造镜像了。制造的时候,要先定个地标,然后才能开始作业。这个地标就是引物,也就是一小段单链 DNA,它会和病毒核酸的特定部位,比如某个基因开头的地方结合。
地标定好了,就可以开始正式的镜像复制黏贴了。复制的过程,靠的是一种叫做 Taq聚合酶 的蛋白质,我们就叫它小T吧。
Taq聚合酶来自生活在温泉里的海栖热袍菌
小T贼强贼好用,50摄氏度的高温都不会熟(变性),因为它来自生活在温泉和深海热泉里的海栖热袍菌。换别的蛋白质,在 PCR 机器的高温里烘一会儿就凉了。咦?
Taq聚合酶(黄色)生产扩增子(白色)
小T只认地标,见到地标才开工。找到作为地标的引物后,小T和溜达鸡似得顺着它一路往下走,就复制出了一段病毒核酸的镜像,这个镜像就叫做扩增子。
如果能检测出扩增子,就能证明出现了我们要找的病毒基因。现在问题来了,DNA 和 RNA 那么小,我们怎么知道有没有产生足够多的扩增子呢?
这时候就要加入
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来源: 观察者网、基因谷
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