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如果新冠病毒挥之不去，那毒株亚型的鉴别会不会成为临床的一种新需求？基于这个问题，我们整理了一些资料，供大家研究。
从12月1日到目前，一共发现31个奥密克戎亚分支输入国内，仍是BA.5.2和BF.7占优势。 
问题1：防病毒转为对症治疗，新毒株是否会引发新的症状？
许多病毒在不断变化，包括导致COVID-19的病毒。这些变化随着时间的推移而发生，并可能导致可能具有新特征的变体的出现，包括不同的传播方式。
目前新冠亚型的监测主要是由CDC来主导，未来极有可能会出现新的变种，而这些变种会不会诱发新的症状犹未可知，对于临床对症治疗的医生而言，可参考的检测结果也会由新冠阳性逐渐转向何种毒株。如果聚焦到毒株亚型的鉴定和新亚种的发现，就无法依托于PCR技术实现了，只能通过基因测序的方式，通过新冠病毒全基因组检测来发现。问题2：检测亚型的目的是什么？在临床上不单单只是流行病学调查
如果亚型监测是疾控来做，这个主要目的是为了流行病学调查，如果是临床做亚型鉴定，那么它的价值就不单单只是流行病学调查，而是有两个方面，第一个是新出现的病症的对症，是不是由新的毒株引起的，这个数据是很宝贵的；第二个是在一些特殊样本，比如说脑脊液、血液、组织等无菌样本中是否检出了新冠病毒，这也是有临床价值的。
对现有毒株鉴定这个实现起来并不难，但是对于一些不在数据库的毒株发现，数据的分析及报告模式是需要去深入研究的。
新冠全基因组测序服务更多的还是对于一些重症的人群，考虑是不是出现了新的病症，新的亚型，往往病情都是比较危急，所用的标本类型也是比较多样化的。成本 的问题一直是测序服务的一个痛点，但是也不是没有办法降，这是一个量价比问题，运营好了，成本也可以很低。
现在基本是三步一个小阳人，五步一个阳康，临床取的标本，从取到实验室的过程中，如何保证规范，隔绝环境与样本间的病原沟通，是一个非常关键的问题。
关于新冠基因组分析和毒株的鉴定，一方面需要有全面的数据库，一方面也需要有较强的生信分析能力。
关于新冠全基因组测序服务，此前市面上已经有很多种了，但是大部分都是用于流行病学调查，未来是不是有临床级、消费级的新冠全基因测序服务的产品快速出现，还是非常值得期待的！
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