免疫是防卫病原体入侵最有效的武器，它分为非特异性免疫和特异性免疫。
特异性免疫又称获得性免疫或适应性免疫，这种免疫只针对一种病原体。它是人体经后天感染(病愈或无症状的感染)或人工预防接种(菌苗、疫苗、类毒素、免疫球蛋白等)而使机体获得的抵抗感染能力。
一般而言，当病原体首次侵染人体，未接种疫苗的人产生能与病原体作用的天然B细胞和T细胞数量是较少的，这时就会引起人生病，直到人体自身能够产生足够的抗体和效应T细胞来清除在体内增殖的病原体，才建立起对付该病原体的防御机制。
疫苗就是模拟病原体入侵，进入人体后引起免疫应答，促使体内免疫系统产生保护性抗体，形成记忆性B细胞与记忆性T细胞。这样当真正的病原体入侵时，已产生的中和抗体便能结合到病原体上，阻止病原体与细胞上的受体结合，从而阻止病原体侵染细胞，同时记忆性B细胞和记忆性T细胞迅速激活启动二次反应，在引起严重疾病前清除感染源。
